Lors d'un effort physique, le corps utilise également les BCAA pour fournir de l'énergie. En l'absence d'apport externe, il puise dans ses propres réserves de tissus musculaires. Les sportifs d'endurance bénéficient d'un apport de BCAA pendant l'effort, car cela permet de préserver les réserves du corps. Les sportifs de force apprécient particulièrement les BCAA, en particulier la leucine, qui agit comme un signal anabolisant pour la synthèse des protéines musculaires. Cela est crucial pour le développement et le maintien de la masse musculaire et a une influence positive sur la récupération. La baisse du taux de BCAA peut augmenter la sensation de fatigue et d'effort chez les sportifs. Ainsi, les athlètes d'endurance trouvent bénéfique d'utiliser les BCAA pendant des efforts prolongés, comme les marathons de vélo et de VTT, les Ironman, les triathlons longue distance et les courses d'ultra, en les combinant judicieusement avec des produits de régénération. Les sportifs de force peuvent prendre des BCAA juste avant l'entraînement et/ou les ajouter à leur shake protéiné après l'entraînement.